La diversité des distributions Linux et la variété de comportement pour une même distribution ne nous permettent pas de garantir un fonctionnement optimal de nos applications sur les postes Linux. Si nous sommes aujourd'hui capables de reproduire l'ensemble des configurations Windows, il n'est pas matériellement possible de réaliser la même chose sous Linux. Par ailleurs, notre équipe d'assistance ne peut pas maîtriser l'ensemble des distributions et de leurs versions. La mise en œuvre de nos logiciels sous Linux reste donc réservée aux établissements disposant sur place des compétences nécessaires, ayant une bonne maîtrise de leur environnement système et de leur pare-feu.